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Auteur (up) Abadie, E.; Kaci, L.; Berteaux, T.; Hess, P.; Sechet, V.; Masseret, E.; Rolland, J.L.; Laabir, M. url  doi
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  Titre Effect of Nitrate, Ammonium and Urea on Growth and Pinnatoxin G Production of Vulcanodinium rugosum Type Article scientifique
  Année 2015 Publication Revue Abrégée Marine Drugs  
  Volume 13 Numéro 9 Pages 5642-5656  
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  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 1660-3397 ISBN Médium  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ alain.herve @ collection 1350  
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Auteur (up) Accolla, C.; Nerini, D.; Maury, O.; Poggiale, J.-C. url  doi
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  Titre Analysis of functional response in presence of schooling phenomena: An IBM approach Type Article scientifique
  Année 2015 Publication Revue Abrégée Progress in Oceanography  
  Volume 134 Numéro Pages 232-243  
  Mots-Clés  
  Résumé The aim of this paper is to analyse the emergence of functional response of a predator–prey system starting from diverse simulations of an Individual-Based Model of schooling fish. Individual characteristics can, indeed, play an important role in establishing group dynamics. The central question we address is whether or not aggregation influences predator–prey relationships. To answer this question, we analyse the consequences of schooling when estimating functional response in four configurations: (1) no schooling of either prey nor predators; (2) schooling of prey only; (3) schooling of predators only; and (4) schooling of both prey and predators. Aggregation is modelled using the rules of attraction, alignment and repulsion. We find important differences between the various configurations, highlighting that functional response is largely affected by collective behaviour. In particular, we show: (1) an increased predation efficiency when prey school and (2) different functional response shapes: Holling type II emerges if prey do not school, while Holling type III emerges when prey aggregate.  
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  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 0079-6611 ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1142  
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Auteur (up) Adamek, Z.; Grecu, I.; Metaxa, I.; Sabarich, L.; Blancheton, J.-P. url  doi
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  Titre Processing traits of European catfish (Silurus glanis Linnaeus, 1758) from outdoor flow-through and indoor recycling aquaculture units Type Article scientifique
  Année 2015 Publication Revue Abrégée Journal of Applied Ichthyology  
  Volume 31 Numéro Pages 38-44  
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  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
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  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 0175-8659 ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1294  
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Auteur (up) Aires, T.; Moalic, Y.; Serrao, E.A.; Arnaud-Haond, S. url  doi
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  Titre Hologenome theory supported by cooccurrence networks of species-specific bacterial communities in siphonous algae (Caulerpa) Type Article scientifique
  Année 2015 Publication Revue Abrégée FEMS Microbiology Ecology  
  Volume 91 Numéro 7 Pages fiv067  
  Mots-Clés  
  Résumé The siphonous algae of the Caulerpa genus harbor internal microbial communities hypothesized to play important roles in development, defense and metabolic activities of the host. Here, we characterize the endophytic bacterial community of four Caulerpa taxa in the Mediterranean Sea, through 16S rRNA amplicon sequencing. Results reveal a striking alpha diversity of the bacterial communities, similar to levels found in sponges and coral holobionts. These comprise (1) a very small core community shared across all hosts (< 1% of the total community), (2) a variable portion (ca. 25%) shared by some Caulerpa taxa but not by all, which might represent environmentally acquired bacteria and (3) a large (>70%) species-specific fraction of the community, forming very specific clusters revealed by modularity in networks of cooccurrence, even in areas where distinct Caulerpa taxa occurred in sympatry. Indirect inferences based on sequence homology suggest that these communities may play an important role in the metabolism of their host, in particular on their ability to grow on anoxic sediment. These findings support the hologenome theory and the need for a holistic framework in ecological and evolutionary studies of these holobionts that frequently become invasive.  
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  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
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  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 1574-6941 ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1407  
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Auteur (up) Albo-Puigserver, M.; Navarro, J.; Coll, M.; Aguzzi, J.; Cardona, L.; Saez-Liante, R. doi  openurl
  Titre Feeding ecology and trophic position of three sympatric demersal chondrichthyans in the northwestern Mediterranean Type Article scientifique
  Année 2015 Publication Revue Abrégée Mar. Ecol.-Prog. Ser.  
  Volume 524 Numéro Pages 255-268  
  Mots-Clés Chimaera monstrosa; chimera-monstrosa; discrimination factors; Etmopterus spinax; etmopterus-spinax linnaeus; Feeding niche; fishing impacts; food-web; Galeus melastomus; galeus-melastomus; interpreting stable-isotopes; Isotope analysis; Mediterranean Sea; portuguese continental-slope; sea; top predators  
  Résumé Understanding how marine predators interact is a scientific challenge. In marine ecosystems, segregation in feeding habits has been largely described as a common mechanism to allow the coexistence of several competing marine predators. However, little is known about the feeding ecology of most species of chondrichthyans, which play a pivotal role in the structure of marine food webs worldwide. In this study, we examined the trophic ecology of 3 relatively abundant chondrichthyans coexisting in the Mediterranean Sea: the blackmouth catshark Galeus melastomus, the velvet belly lanternshark Etmopterus spinax and the rabbit fish Chimaera monstrosa. To examine their trophic ecology and interspecific differences in food habits, we combined the analysis of stomach content and stable isotopes. Our results highlighted a trophic segregation between C. monstrosa and the other 2 species. G. melastomus showed a diet composed mainly of cephalopods, while E. spinax preyed mainly on shrimps and C. monstrosa on crabs. Interspecific differences in the trophic niche were likely due to different feeding capabilities and body size. Each species showed different isotopic niche space and trophic level. Specifically, C. monstrosa showed a higher trophic level than E. spinax and G. melastomus. The high trophic levels of the 3 species highlighted their important role as predators in the marine food web. Our results illustrate the utility of using complementary approaches that provide information about the feeding behaviour at short (stomach content) and long-term scales (stable isotopes), which could allow more efficient monitoring of marine food-web changes in the study area.  
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  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue English Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 0171-8630 ISBN Médium  
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  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1245  
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