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Auteur Chaboud, C. url  isbn
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  Titre Economie des pêches Type Chapitre de livre
  Année 2014 Publication Revue Abrégée  
  Volume Numéro Pages 277-344  
  Mots-Clés Amenagement Des Peches; Demande; Economie De Marche; Economie Des Peches; Effort De Peche; Gestion Des Peches; Groupe D'Age; Modele Bioeconomique; Modelisation; Prix; Ressources Halieutiques  
  Résumé  
  Adresse  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Iste Lieu de Publication Londres Éditeur Monaco, A.; Prouzet, P.  
  Langue fre Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Mer et Océan Titre de collection Abrégé Valorisation et économie des ressources marines  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN ISBN 9781784050 Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection (down) 1316  
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Auteur Restrepo-Ortiz, C.X.; Auguet, J.C.; Casamayor, E.O. doi  openurl
  Titre Targeting spatiotemporal dynamics of planktonic SAGMGC-1 and segregation of ammonia-oxidizing thaumarchaeota ecotypes by newly designed primers and quantitative polymerase chain reaction Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Environmental Microbiology  
  Volume 16 Numéro 3 Pages 689-700  
  Mots-Clés  
  Résumé The annual dynamics of three different ammonia-oxidizing archaea (AOA) ecotypes (amoA gene) and of the SAGMGC-1 (Nitrosotalea-like aquatic Thaumarchaeota) group (16S rRNA gene) were studied by newly designed specific primers and quantitative polymerase chain reaction analysis in a deep oligotrophic high mountain lake (Lake Redon, Limnological Observatory of the Pyrenees, Spain). We observed segregated distributions of the main AOA populations, peaking separately in time and space, and under different ammonia concentrations and irradiance conditions. Strong positive correlation in gene abundances was found along the annual survey between 16S rRNA SAGMAGC-1 and one of the amoA ecotypes suggesting the potential for ammonia oxidation in the freshwater SAGMAGC-1 clade. We also observed dominance of Nitrosotalea-like ecotypes over Nitrosopumilus-like (Marine Group 1.1a) and not the same annual dynamics for the two thaumarchaeotal clades. The fine scale segregation in space and time of the different AOA ecotypes indicated the presence of phylogenetically close but ecologically segregated AOA species specifically adapted to specific environmental conditions. It remains to be elucidated what would be such environmental drivers.  
  Adresse  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection (down) 1313  
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Auteur Merbt, S.N.; Auguet, J.C.; Blesa, A.; Marti, E.; Casamayor, E.O. doi  openurl
  Titre Wastewater Treatment Plant Effluents Change Abundance and Composition of Ammonia-Oxidizing Microorganisms in Mediterranean Urban Stream Biofilms Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Microb Ecol  
  Volume Numéro Pages  
  Mots-Clés  
  Résumé  
  Adresse  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection (down) 1312  
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Auteur PERNET, F.; LAGARDE, F.; JEANNEE, N.; DAIGLE, G.; BARRET, J.; LE GALL, P.; QUERE, C.; ROQUE D'ORBCASTEL, E. url  openurl
  Titre Spatial and Temporal Dynamics of Mass Mortalities in Oysters Is Influenced by Energetic Reserves and Food Quality Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Plos One Revue Abrégée  
  Volume 9 Numéro 2 Pages e88469  
  Mots-Clés  
  Résumé Although spatial studies of diseases on land have a long history, far fewer have been made on aquatic diseases. Here, we present the first large-scale, high-resolution spatial and temporal representation of a mass mortality phenomenon cause by the Ostreid herpesvirus (OsHV-1) that has affected oysters (Crassostrea gigas) every year since 2008, in relation to their energetic reserves and the quality of their food. Disease mortality was investigated in healthy oysters deployed at 106 locations in the Thau Mediterranean lagoon before the start of the epizootic in spring 2011. We found that disease mortality of oysters showed strong spatial dependence clearly reflecting the epizootic process of local transmission. Disease initiated inside oyster farms spread rapidly beyond these areas. Local differences in energetic condition of oysters, partly driven by variation in food quality, played a significant role in the spatial and temporal dynamics of disease mortality. In particular, the relative contribution of diatoms to the diet of oysters was positively correlated with their energetic reserves, which in turn decreased the risk of disease mortality.  
  Adresse Univ Laval, Dept Math & Stat, Quebec City, PQ G1K 7P4, Canada.  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Public Library Science Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 1932-6203 ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ 29249 collection (down) 1218  
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Auteur PERNET, F.; LAGARDE, F.; LE GALL, P.; ROQUE D'ORBCASTEL, E. url  openurl
  Titre Associations between farming practices and disease mortality of Pacific oyster Crassostrea gigas in a Mediterranean lagoon Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Aquaculture Environment Interactions Revue Abrégée  
  Volume 5 Numéro 2 Pages 99-106  
  Mots-Clés Aquaculture; Epidemiology; OsHV-1; Shellfish farming  
  Résumé We present the first large-scale, high-resolution spatial and temporal pattern of disease mortality caused by Ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) that has affected Pacific oyster Crassostrea gigas in France every year since 2008, in relation to local farm use. Mortality was monitored in healthy oyster spat deployed at 106 locations in the Thau Mediterranean lagoon during the epizootic that occurred in spring 2011. We conducted a field survey of farming practices in the areas where the sentinel oysters were placed before the epizootic. We found that the risk of disease mortality in sentinel oysters was higher within the bivalve farming area than outside it, suggesting that the infection pressure is much higher in areas with intensive farming activity. The risk of mortality was higher in farms rearing spat, a developmental stage particularly susceptible to OsHV-1, than in farms rearing adult oysters, which are generally more resistant. Additionally, the mortality risk in farms rearing adult animals was similar to that in empty farms, which suggests that, during the study period, adult oysters did not vector the disease. Interestingly, the mortality risk for sentinel oysters deployed in mussel Mytilus galloprovincialis farms was lower than for those held in oyster farms or empty farms, suggesting that mussels reduced the infection pressure on susceptible oysters.  
  Adresse UMR LEMAR Ifremer CNRS UBO IRD, Technopole Brest Iroise, F-29280 Plouzane, France.  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Inter-research Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 1869-215x ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ 31248 collection (down) 1217  
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