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Auteur Przybyla, C.; Fievet, J.; Callier, M.; Blancheton, J.-P. doi  openurl
  Titre Effect of dietary water content on European sea bass (Dicentrarchus labrax) growth and disease resistance Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Aquat. Living Resour.  
  Volume 27 Numéro 2 Pages 73-81  
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Auteur Lorin-Nebel, C.; Budzinski, H.; Le Ménach, K.; Devier, M.H.; Charmantier, G.; Gros, R.; Grousset, E.; Blondeau-Bidet, E.; Farcy, E. doi  openurl
  Titre 4-Nonylphenol disrupts osmoregulation in the European sea-bass Dicentrarchus labrax Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Journal of Xenobiotics  
  Volume 4 Numéro Pages 4905-4907  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 418  
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Auteur Cooke, S.J.; Killen, S.S.; Metcalfe, J.D.; McKenzie, D.J.; Mouillot, D.; Jørgensen, C.; Peck, M.A. url  doi
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  Titre Conservation physiology across scales: insights from the marine realm Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Conservation Physiology  
  Volume 2 Numéro 1 Pages  
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  Résumé As the field of conservation physiology develops and becomes increasingly integrated with ecology and conservation science, the fundamental concept of scale is being recognized as important, particularly for ensuring that physiological knowledge is contextualized in a manner most relevant to policy makers, conservation practitioners and stakeholders. Failure to consider the importance of scale in conservation physiology—both the challenges and the opportunities that it creates—will impede the ability of this discipline to generate the scientific understanding needed to contribute to meaningful conservation outcomes. Here, we have focused on five aspects of scale: biological, spatial, temporal, allometric and phylogenetic. We also considered the scale of policy and policy application relevant to those five types of scale as well as the merits of upscaling and downscaling to explore and address conservation problems. Although relevant to all systems (e.g. freshwater, terrestrial) we have used examples from the marine realm, with a particular emphasis on fishes, given the fact that there is existing discourse regarding scale and its relevance for marine conservation and management. Our synthesis revealed that all five aspects of scale are relevant to conservation physiology, with many aspects inherently linked. It is apparent that there are both opportunities and challenges afforded by working across scales but, to understand mechanisms underlying conservation problems, it is essential to consider scale of all sorts and to work across scales to the greatest extent possible. Moreover, given that the scales in biological processes will often not match policy and management scales, conservation physiology needs to show how it is relevant to aspects at different policy/management scales, change the scales at which policy/management intervention is applied or be prepared to be ignored.  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 504  
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Auteur Merbt, S.N.; Auguet, J.C.; Blesa, A.; Marti, E.; Casamayor, E.O. doi  openurl
  Titre Wastewater Treatment Plant Effluents Change Abundance and Composition of Ammonia-Oxidizing Microorganisms in Mediterranean Urban Stream Biofilms Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Microb Ecol  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1312  
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Auteur Restrepo-Ortiz, C.X.; Auguet, J.C.; Casamayor, E.O. doi  openurl
  Titre Targeting spatiotemporal dynamics of planktonic SAGMGC-1 and segregation of ammonia-oxidizing thaumarchaeota ecotypes by newly designed primers and quantitative polymerase chain reaction Type Article scientifique
  Année 2014 Publication Revue Abrégée Environmental Microbiology  
  Volume 16 Numéro 3 Pages 689-700  
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  Résumé The annual dynamics of three different ammonia-oxidizing archaea (AOA) ecotypes (amoA gene) and of the SAGMGC-1 (Nitrosotalea-like aquatic Thaumarchaeota) group (16S rRNA gene) were studied by newly designed specific primers and quantitative polymerase chain reaction analysis in a deep oligotrophic high mountain lake (Lake Redon, Limnological Observatory of the Pyrenees, Spain). We observed segregated distributions of the main AOA populations, peaking separately in time and space, and under different ammonia concentrations and irradiance conditions. Strong positive correlation in gene abundances was found along the annual survey between 16S rRNA SAGMAGC-1 and one of the amoA ecotypes suggesting the potential for ammonia oxidation in the freshwater SAGMAGC-1 clade. We also observed dominance of Nitrosotalea-like ecotypes over Nitrosopumilus-like (Marine Group 1.1a) and not the same annual dynamics for the two thaumarchaeotal clades. The fine scale segregation in space and time of the different AOA ecotypes indicated the presence of phylogenetically close but ecologically segregated AOA species specifically adapted to specific environmental conditions. It remains to be elucidated what would be such environmental drivers.  
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  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 1313  
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