| Enregistrements |
| Auteur |
Restrepo-Ortiz, C.X.; Auguet, J.C.; Casamayor, E.O. |
| Titre |
Targeting spatiotemporal dynamics of planktonic SAGMGC-1 and segregation of ammonia-oxidizing thaumarchaeota ecotypes by newly designed primers and quantitative polymerase chain reaction |
Type |
Article scientifique |
| Année |
2014 |
Publication |
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Revue Abrégée |
Environmental Microbiology |
| Volume |
16 |
Numéro |
3 |
Pages |
689-700 |
| Mots-Clés |
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| Résumé |
The annual dynamics of three different ammonia-oxidizing archaea (AOA) ecotypes (amoA gene) and of the SAGMGC-1 (Nitrosotalea-like aquatic Thaumarchaeota) group (16S rRNA gene) were studied by newly designed specific primers and quantitative polymerase chain reaction analysis in a deep oligotrophic high mountain lake (Lake Redon, Limnological Observatory of the Pyrenees, Spain). We observed segregated distributions of the main AOA populations, peaking separately in time and space, and under different ammonia concentrations and irradiance conditions. Strong positive correlation in gene abundances was found along the annual survey between 16S rRNA SAGMAGC-1 and one of the amoA ecotypes suggesting the potential for ammonia oxidation in the freshwater SAGMAGC-1 clade. We also observed dominance of Nitrosotalea-like ecotypes over Nitrosopumilus-like (Marine Group 1.1a) and not the same annual dynamics for the two thaumarchaeotal clades. The fine scale segregation in space and time of the different AOA ecotypes indicated the presence of phylogenetically close but ecologically segregated AOA species specifically adapted to specific environmental conditions. It remains to be elucidated what would be such environmental drivers. |
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| Auteur institutionnel |
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Thèse |
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Lieu de Publication |
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Éditeur |
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Langue du Résumé |
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Titre Original |
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Titre de collection Abrégé |
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Numéro de collection |
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Edition |
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Médium |
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Expédition  |
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Conférence |
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Approuvé |
pas de |
| Numéro d'Appel |
MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ |
collection |
1313 |
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| Auteur |
Chaboud, C. |
| Titre |
Economie des pêches |
Type |
Chapitre de livre |
| Année |
2014 |
Publication |
|
Revue Abrégée |
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| Volume |
|
Numéro |
|
Pages |
277-344 |
| Mots-Clés |
Amenagement Des Peches; Demande; Economie De Marche; Economie Des Peches; Effort De Peche; Gestion Des Peches; Groupe D'Age; Modele Bioeconomique; Modelisation; Prix; Ressources Halieutiques |
| Résumé |
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| Adresse |
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| Auteur institutionnel |
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Thèse |
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| Editeur |
Iste |
Lieu de Publication |
Londres |
Éditeur |
Monaco, A.; Prouzet, P. |
| Langue |
fre |
Langue du Résumé |
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Titre Original |
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| Éditeur de collection |
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Titre de collection |
Mer et Océan |
Titre de collection Abrégé |
Valorisation et économie des ressources marines |
| Volume de collection |
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Numéro de collection |
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Edition |
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| ISSN |
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ISBN |
9781784050 |
Médium |
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| Région |
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Expédition |
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Conférence |
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| Notes |
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Approuvé |
pas de |
| Numéro d'Appel |
MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ |
collection |
1316 |
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| Auteur |
Chaboud, C. |
| Titre |
Fisheries economics |
Type |
Chapitre de livre |
| Année |
2014 |
Publication |
|
Revue Abrégée |
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| Volume |
|
Numéro |
|
Pages |
153-231 |
| Mots-Clés |
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| Résumé |
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| Adresse |
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| Auteur institutionnel |
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Thèse |
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| Editeur |
Iste |
Lieu de Publication |
Londres |
Éditeur |
Monaco, A.; Prouzet, P. |
| Langue |
eng |
Langue du Résumé |
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Titre Original |
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| Éditeur de collection |
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Titre de collection |
ISTE Oceanography and Marine Biology Series : Seas and Oceans Set |
Titre de collection Abrégé |
Value and economy of marine resources |
| Volume de collection |
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Numéro de collection |
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Edition |
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| ISSN |
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ISBN |
9781848217 |
Médium |
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| Région |
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Expédition |
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Conférence |
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| Notes |
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Approuvé |
pas de |
| Numéro d'Appel |
MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ |
collection |
1317 |
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| Auteur |
Collos, Y.; Jauzein, C.; Hatey, E. |
| Titre |
Particulate carbon and nitrogen determinations in tracer studies: The neglected variables |
Type |
Article scientifique |
| Année |
2014 |
Publication |
Applied Radiation and Isotopes |
Revue Abrégée |
|
| Volume |
94 |
Numéro |
|
Pages |
14-22 |
| Mots-Clés |
Suspended particulate matter; Carbon; Nitrogen; Adsorption; Material loss; Phytoplankton |
| Résumé |
Abstract
We address two issues in the determination of particulate carbon and nitrogen in suspended matter of aquatic environments. One is the adsorption of dissolved organic matter on filters, leading to overestimate particulate matter. The second is the material loss during filtration due to fragile algal cells breaking up. Examples from both laboratory cultures and natural samples are presented. We recommend using stacked filters in order to estimate the first and filtering different volumes of water in order to evaluate the second. |
| Adresse |
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| Auteur institutionnel |
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Thèse |
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| Editeur |
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Lieu de Publication |
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Éditeur |
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| Langue |
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Langue du Résumé |
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Titre Original |
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| Éditeur de collection |
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Titre de collection |
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Titre de collection Abrégé |
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| Volume de collection |
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Numéro de collection |
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Edition |
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| ISSN |
0969-8043 |
ISBN |
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Médium |
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| Région |
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Expédition |
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Conférence |
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| Notes |
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Approuvé |
pas de |
| Numéro d'Appel |
MARBEC @ alain.herve @ |
collection |
1318 |
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| Auteur |
Mari, X.; Lefevre, J.; Torreton, J.P.; Bettarel, Y.; Pringault, O.; Rochelle-Newall, E.; Marchesiello, P.; Menkes, C.; Rodier, M.; Migon, C.; Motegi, C.; Weinbauer, M.G.; Legendre, L. |
| Titre |
Effects of soot deposition on particle dynamics and microbial processes in marine surface waters |
Type |
Article scientifique |
| Année |
2014 |
Publication |
|
Revue Abrégée |
Global Biogeochemical Cycles |
| Volume |
28 |
Numéro |
7 |
Pages |
662-678 |
| Mots-Clés |
aerosols; black carbon; coral-reef lagoon; dissolved organic-matter; new-caledonia; ocean; Sea; sediments; size spectra; tep |
| Résumé |
Large amounts of soot are continuously deposited on the global ocean. Even though significant concentrations of soot particles are found in marine waters, the effects of these aerosols on ocean ecosystems are currently unknown. Using a combination of in situ and experimental data, and results from an atmospheric transport model, we show that the deposition of soot particles from an oil-fired power plant impacted biogeochemical properties and the functioning of the pelagic ecosystem in tropical oligotrophic oceanic waters off New Caledonia. Deposition was followed by a major increase in the volume concentration of suspended particles, a change in the particle size spectra that resulted from a stimulation of aggregation processes, a 5% decrease in the concentration of dissolved organic carbon (DOC), a decreases of 33 and 23% in viral and free bacterial abundances, respectively, and a factor similar to 2 increase in the activity of particle-attached bacteria suggesting that soot introduced in the system favored bacterial growth. These patterns were confirmed by experiments with natural seawater conducted with both soot aerosols collected in the study area and standard diesel soot. The data suggest a strong impact of soot deposition on ocean surface particles, DOC, and microbial processes, at least near emission hot spots. |
| Adresse |
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| Auteur institutionnel |
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Thèse |
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| Editeur |
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Lieu de Publication |
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Éditeur |
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| Langue |
English |
Langue du Résumé |
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Titre Original |
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| Éditeur de collection |
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Titre de collection |
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Titre de collection Abrégé |
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| Volume de collection |
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Numéro de collection |
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Edition |
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| ISSN |
0886-6236 |
ISBN |
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Médium |
|
| Région |
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Expédition |
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Conférence |
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| Notes |
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Approuvé |
pas de |
| Numéro d'Appel |
MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ |
collection |
554 |
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