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Auteur (up) Andrello, M.; Noirot, C.; Debarre, F.; Manel, S. doi  openurl
  Titre MetaPopGen 2.0: A multilocus genetic simulator to model populations of large size Type Article scientifique
  Année 2020 Publication Revue Abrégée Mol. Ecol. Resour.  
  Volume Numéro Pages  
  Mots-Clés adaptation; connectivity; dispersal; evolutionary; flow; genetic simulator; landscape genetics; mullus-surmuletus; program; spatially explicit  
  Résumé Multilocus genetic processes in subdivided populations can be complex and difficult to interpret using theoretical population genetics models. Genetic simulators offer a valid alternative to study multilocus genetic processes in arbitrarily complex scenarios. However, the use of forward-in-time simulators in realistic scenarios involving high numbers of individuals distributed in multiple local populations is limited by computation time and memory requirements. These limitations increase with the number of simulated individuals. We developed a genetic simulator, MetaPopGen 2.0, to model multilocus population genetic processes in subdivided populations of arbitrarily large size. It allows for spatial and temporal variation in demographic parameters, age structure, adult and propagule dispersal, variable mutation rates and selection on survival and fecundity. We developed MetaPopGen 2.0 in the R environment to facilitate its use by non-modeler ecologists and evolutionary biologists. We illustrate the capabilities of MetaPopGen 2.0 for studying adaptation to water salinity in the striped red mullet Mullus surmuletus.  
  Adresse  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue English Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN 1755-098x ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes WOS:000590613600001 Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 2919  
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