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Auteur (up) Juhel, J.-B.; Utama, R.S.; Marques, V.; Vimono, I.B.; Sugeha, H.Y.; Kadarusman, null; Pouyaud, L.; Dejean, T.; Mouillot, D.; Hocdé, R. url  doi
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  Titre Accumulation curves of environmental DNA sequences predict coastal fish diversity in the coral triangle Type Article scientifique
  Année 2020 Publication Revue Abrégée Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences  
  Volume 287 Numéro 1930 Pages 20200248  
  Mots-Clés  
  Résumé Environmental DNA (eDNA) has the potential to provide more comprehensive biodiversity assessments, particularly for vertebrates in species-rich regions. However, this method requires the completeness of a reference database (i.e. a list of DNA sequences attached to each species), which is not currently achieved for many taxa and ecosystems. As an alternative, a range of operational taxonomic units (OTUs) can be extracted from eDNA metabarcoding. However, the extent to which the diversity of OTUs provided by a limited eDNA sampling effort can predict regional species diversity is unknown. Here, by modelling OTU accumulation curves of eDNA seawater samples across the Coral Triangle, we obtained an asymptote reaching 1531 fish OTUs, while 1611 fish species are recorded in the region. We also accurately predict (R² = 0.92) the distribution of species richness among fish families from OTU-based asymptotes. Thus, the multi-model framework of OTU accumulation curves extends the use of eDNA metabarcoding in ecology, biogeography and conservation.  
  Adresse  
  Auteur institutionnel Thèse  
  Editeur Lieu de Publication Éditeur  
  Langue Langue du Résumé Titre Original  
  Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé  
  Volume de collection Numéro de collection Edition  
  ISSN ISBN Médium  
  Région Expédition Conférence  
  Notes Approuvé pas de  
  Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 2807  
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