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Auteur Tisseuil, C.; Leprieur, F.; Grenouillet, G.; Vrac, M.; Lek, S.
Titre Projected impacts of climate change on spatio-temporal patterns of freshwater fish beta diversity: a deconstructing approach Type Article scientifique
Année (up) 2012 Publication Revue Abrégée Global Ecology and Biogeography
Volume 21 Numéro 12 Pages 1213-1222
Mots-Clés Beta diversity; France; ensemble forecasting; freshwater fish; nestedness; species distribution model; temporal changes; turnover
Résumé
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 1466-8238 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 799
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Auteur Caro, A.; Escalas, A.; Bouvier, C.; Grousset, E.; Lautredou-Audouy, N.; Roques, C.; Charmantier, M.; Gros, O.
Titre Epibiotic bacterial community of Sphaeroma serratum (Crustacea, Isopoda): relationship with molt status Type Article scientifique
Année (up) 2012 Publication Revue Abrégée Mar. Ecol.-Prog. Ser.
Volume 457 Numéro Pages 11-27
Mots-Clés 16s ribosomal-rna; Crustacean; DGGE band pattern; Epibiotic biofilm; Molt cycle; Sphaeroma; fish; gastropod; gradient gel-electrophoresis; hydrothermal-vent; in-situ hybridization; mid-atlantic ridge; oxidizing bacteria; phylogenetic diversity; riftia-pachyptila; shrimp rimicaris-exoculata; urothoe-poseidonis
Résumé Sphaeroma serratum is a marine isopod species that inhabits seashores from Europe to West Africa. The individuals live under stones in direct contact with reduced sediments and harbour a diverse bacterial community on the cuticle of their pleopods. We investigated the diversity of these epibiotic bacteria on male (pubescent and senescent) and female specimens with electron microscopic observations and molecular tools. The microbial community of S. serratum was shown to be composed of at least 5 bacterial morphotypes observed on the pleopodal cuticle in all male specimens. Using fluorescence in situ hybridization, we identified 5 major phylogenetic groups (alpha-, beta-, gamma- and delta-Proteobacteria and Archaea) whereas denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of PCR-amplified 16S rRNA gene fragments of epibiotic bacteria revealed 50 bands. The bacterial community associated with S. serratum seems more diverse than in other marine crustaceans, such as Rimicaris. The relative diversity of this bacterial community was also studied in relation to the molt cycle. The comparison of DGGE band patterns of several individuals from female, pubescent male and senescent male groups revealed that the bacterial community diversity was dependent on the sex and the age of the individuals and more generally on the molt status.
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue English Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0171-8630 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 564
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Auteur Pommier, T.; Douzery, E.J.P.; Mouillot, D.
Titre Environment drives high phylogenetic turnover among oceanic bacterial communities Type Article scientifique
Année (up) 2012 Publication Revue Abrégée Biol. Lett.
Volume 8 Numéro 4 Pages 562-566
Mots-Clés Biogeography; connectivity; diversity; dynamics; patterns; phylogenetic turnover
Résumé Although environmental filtering has been observed to influence the biodiversity patterns of marine bacterial communities, it was restricted to the regional scale and to the species level, leaving the main drivers unknown at large biogeographic scales and higher taxonomic levels. Bacterial communities with different species compositions may nevertheless share phylogenetic lineages, and phylogenetic turnover (PT) among those communities may be surprisingly low along any biogeographic or environmental gradient. Here, we investigated the relative influence of environmental filtering and geographical distance on the PT between marine bacterial communities living more than 8000 km apart in contrasted abiotic conditions. PT was high between communities and was more structured by local environmental factors than by geographical distance, suggesting the predominance of a lineage filtering process. Strong phenotype-environment mismatches observed in the ocean may surpass high connectivity between marine microbial communities.
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue English Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 1744-9561 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 567
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Auteur van der Heide, T.; Govers, L.L.; de Fouw, J.; Olff, H.; van der Geest, M.; van Katwijk, M.M.; Piersma, T.; van de Koppel, J.; Silliman, B.R.; Smolders, A.J.P.; van Gils, J.A.
Titre A three-stage symbiosis forms the foundation of seagrass ecosystems Type Article scientifique
Année (up) 2012 Publication Revue Abrégée Science
Volume 336 Numéro Pages 1432-1434
Mots-Clés mutualistic networks zostera-marina biodiversity bivalves sulfide architecture diversity sediments bacteria mollusca
Résumé Seagrasses evolved from terrestrial plants into marine foundation species around 100 million years ago. Their ecological success, however, remains a mystery because natural organic matter accumulation within the beds should result in toxic sediment sulfide levels. Using a meta-analysis, a field study, and a laboratory experiment, we reveal how an ancient three-stage symbiosis between seagrass, lucinid bivalves, and their sulfide-oxidizing gill bacteria reduces sulfide stress for seagrasses. We found that the bivalve-sulfide-oxidizer symbiosis reduced sulfide levels and enhanced seagrass production as measured in biomass. In turn, the bivalves and their endosymbionts profit from organic matter accumulation and radial oxygen release from the seagrass roots. These findings elucidate the long-term success of seagrasses in warm waters and offer new prospects for seagrass ecosystem conservation.
Adresse [van der Heide, Tjisse; Olff, Han] Univ Groningen, CEES, Community & Conservat Ecol Grp, NL-9700 CC Groningen, Netherlands. [Govers, Laura L.; van Katwijk, Marieke M.] Radboud Univ Nijmegen, Dept Environm Sci, Inst Water & Wetland Res, Fac Sci, NL-6525 AJ Nijmegen, Netherlands. [de Fouw, Jimmy; van der Geest, Matthijs; Piersma, Theunis; van Gils, Jan A.] NIOZ Royal Netherlands Inst Sea Res, Dept Marine Ecol, NL-1790 AB Den Burg, Texel, Netherlands. [Piersma, Theunis] Univ Groningen, CEES, Anim Ecol Grp, NL-9700 CC Groningen, Netherlands. [van de Koppel, Johan] NIOZ Royal Netherlands Inst Sea Res, Ctr Estuarine & Marine Ecol, NL-4400 AC Yerseke, Netherlands. [Silliman, Brian R.] Univ Florida, Dept Biol, Gainesville, FL 32611 USA. [Smolders, Alfons J. P.] Radboud Univ Nijmegen, Inst Water & Wetland Res, Dept Aquat Ecol & Environm Biol, Fac Sci, NL-6525 AJ Nijmegen, Netherlands. van der Heide, T (reprint author), Univ Groningen, CEES, Community & Conservat Ecol Grp, POB 11103, NL-9700 CC Groningen, Netherlands t.van.der.heide@rug.nl
Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue English Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0036-8075 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
Notes ISI Document Delivery No.: 958BT Times Cited: 0 Cited Reference Count: 27 van der Heide, Tjisse Govers, Laura L. de Fouw, Jimmy Olff, Han van der Geest, Matthijs van Katwijk, Marieke M. Piersma, Theunis van de Koppel, Johan Silliman, Brian R. Smolders, Alfons J. P. van Gils, Jan A. “Waddenfonds” program; Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO)-WOTRO[W.01.65.221.00]; NWO-VIDI[864.09.002]; NSF; Andrew Mellon Foundation; Royal Netherlands Academy We thank G. Quaintenne and H. Blanchet for their help with the collection of Loripes; J. Eygensteyn and E. Pierson for technical assistance; and G. J. Vermeij, H. de Kroon, T. J. Bouma, E. J. Weerman, and C. Smit for their comments on the manuscript. T.v.d.H. was financially supported by the “Waddenfonds” program; M.v.d.G. and T.P. by the Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO)-WOTRO Integrated Programme grant W.01.65.221.00 awarded to T.P.; and J.d.F. and J.v.G. by the NWO-VIDI grant 864.09.002 awarded to J.v.G. B.S. was supported by an NSF CAREER award, the Andrew Mellon Foundation, and the Royal Netherlands Academy Visiting Professorship. The authors declare no conflicts of interest. A detailed description of all materials and methods, sources, as well as supplementary information are available as supplementary materials. The data are deposited in DRYAD at http://dx.doi.org/10.5061/dryad.210mp. Amer assoc advancement science Washington Approuvé pas de
Numéro d'Appel MARBEC @ alain.herve @ 734 collection 1381
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Auteur Poisot, T.; Canard, E.; Mouillot, D.; Mouquet, N.; Gravel, D.
Titre The dissimilarity of species interaction networks Type Article scientifique
Année (up) 2012 Publication Revue Abrégée Ecology Letters
Volume 15 Numéro 12 Pages 1353-1361
Mots-Clés food web; metaweb; species interaction networks; β-diversity
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 1461-0248 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 903
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