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Enregistrements
Auteur Le Chevanton, M.; Garnier, M.; Bougaran, G.; Schreiber, N.; Lukomska, E.; Bérard, J.B.; Fouilland, E.; Bernard, O.; Cadoret, J.P.
Titre Screening and selection of growth-promoting bacteria for Dunaliella cultures Type Article scientifique
Année 2013 Publication Revue Abrégée Algal Research
Volume 2 Numéro Pages 212-222
Mots-Clés Bacterial diversity; Dunaliella; Interaction; bacteria; microalgae
Résumé
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue (up) Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 2211-9264 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 815
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Auteur Amossé, J.; Bettarel, Y.; Bouvier, C.; Bouvier, T.; Tran Duc, T.; Doan Thu, T.; Jouquet, P.
Titre The flows of nitrogen, bacteria and viruses from the soil to water compartments are influenced by earthworm activity and organic fertilization (compost vs. vermicompost) Type Article scientifique
Année 2013 Publication Revue Abrégée Soil Biology & Biochemistry
Volume 66 Numéro Pages 197-203
Mots-Clés Bacterial and viral abundance; Bacterial diversity; Compost; Dichogaster bolaui; Earthworms; Leaching; Organic fertilization; Vermicompost
Résumé
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Auteur institutionnel Thèse
Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue (up) Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0038-0717 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
Notes Approuvé pas de
Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 892
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Auteur Louati, H.; Ben Said, O.; Soltani, A.; Got, P.; Mahmoudi, E.; Cravo-Laureau, C.; Duran, R.; Aissa, P.; Pringault, O.
Titre The roles of biological interactions and pollutant contamination in shaping microbial benthic community structure Type Article scientifique
Année 2013 Publication Revue Abrégée Chemosphere
Volume 93 Numéro 10 Pages 2535-2546
Mots-Clés Bioremediation; Meiofauna; Microcosms; PAH-degraders; bacteria; bizerte lagoon
Résumé
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Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue (up) Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0045-6535 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 894
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Auteur Bouvy, M.; Combe, M.; Bettarel, Y.; Dupuy, C.; Rochelle-Newall, E.; Charpy, L.
Titre Uncoupled viral and bacterial distributions in coral reef waters of Tuamotu Archipelago (French Polynesia) Type Article scientifique
Année 2012 Publication Revue Abrégée Marine Pollution Bulletin
Volume 65 Numéro 10–12 Pages 506-515
Mots-Clés Coral reef waters; Distributions; Strategy lifes; Virus; bacteria
Résumé This study examined the distribution of virioplankton and bacterioplankton in two coral reef systems (Ahe and Takaroa atolls) in the Tuamotu Archipelago, in comparison with the surrounding oligotrophic ocean. Mean concentrations of 4.8 × 105 and 6.2 × 105 cells ml−1 for bacteria and 8.1 × 106 and 4.3 × 106 VLP (virus-like particle) ml−1 were recorded in Ahe and Takaroa lagoons, respectively. Chlorophyll-a concentrations and dissolved organic matter were higher in Ahe whereas 3H thymidine incorporation rates were higher in Takaroa. First data on lytic and lysogenic strategies of phages in coral reef environments were discussed in this paper. The fraction of visibly infected cells by viruses was negligible regardless of the lagoon station (mean = 0.15%). However, the fraction of lysogenic cells ranged between 2.5% and 88.9%. Our results suggest that the distribution patterns of virioplankton are apparently not coupled to the spatial dynamics of the bacterioplankton communities.
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Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue (up) Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0025-326x ISBN Médium
Région Expédition Conférence
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Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 923
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Auteur Doan, T.T.; Bouvier, C.; Bettarel, Y.; Bouvier, T.; Henry-des-Tureaux, T.; Janeau, J.L.; Lamballe, P.; Nguyen, B.V.; Jouquet, P.
Titre Influence of buffalo manure, compost, vermicompost and biochar amendments on bacterial and viral communities in soil and adjacent aquatic systems Type Article scientifique
Année 2014 Publication Revue Abrégée Applied Soil Ecology
Volume 73 Numéro Pages 78-86
Mots-Clés Mesocosms; Organic fertilization; Soil; Virus; bacteria; water
Résumé Vermicompost and biochar amendments are management practices which may contribute to sustainable agroecosystems by reducing dependence on inorganic fertilizers. However, little is known about their impacts on soil microorganisms and their transfer and evolution in connected aquatic systems. The aim of this study was to determine the influence of organic manure (buffalo manure, compost or vermicompost) and biochar amendments on bacterial and viral properties in soil and water. A three year experiment was carried out with terrestrial mesocosms which were used to test the effect of organic matter amendment on maize growth. In the last year of the experiment, runoff and infiltration waters from the terrestrial mesocosms were transferred to aquatic mesocosms. Organic fertilization improved soil properties (higher C, N content and pH H 2 O ) and as a consequence increased soil bacterial and viral abundance. Bacterial diversity (Shannon ‘H’ and richness ‘S’ indices calculated from DGGE fingerprint) was also enhanced after the continuous application of organic amendments. Compared with compost, vermicompost reduced viral abundance and S but similar H and bacterial abundance were observed. The pH H 2 O , C content and bacterial and viral abundance increased in the aquatic mesocosms following organic fertilization. As a consequence, bacterial and viral diversity also increased in the water, although no differences were found between compost and vermicompost. Biochar increased soil bacterial abundance for the mineral fertilizer treatment but did not influence bacterial and viral abundance in water. However, the combination of biochar and vermicompost led to an increase of viruses in soil and a reduction of bacteria in water. Similarity dendrograms from the DGGE banding patterns showed that the structure of bacterial communities was mainly influenced by the fertilizer treatments in soil but by the presence of biochar in water. In conclusion, this study demonstrated that the nature of the organic amendment has important consequences on both soil and water microbial abundance and diversity.
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Editeur Lieu de Publication Éditeur
Langue (up) Langue du Résumé Titre Original
Éditeur de collection Titre de collection Titre de collection Abrégé
Volume de collection Numéro de collection Edition
ISSN 0929-1393 ISBN Médium
Région Expédition Conférence
Notes Approuvé pas de
Numéro d'Appel MARBEC @ isabelle.vidal-ayouba @ collection 673
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