Suivi des communautés microbiennes de Thau (bactériennes et planctoniques)

, par Hocdé Régis

OBJECTIFS

Suivi de la dynamique de populations et de la diversité des communautés microbiennes sur un pas de temps court (prélèvement tous les 15j), établissement des drivers de ces fluctuations temporelles sur le court et le long terme, surveillance de la diversité des communautés (disparition et apparition d'espèces), mise à disposition de la communauté scientifique d'une banque d'ADN planctonique total, mise à disposition du plus de données possibles existant sur les communautés planctoniques de la lagune de Thau



DESCRIPTION

Coordination
  • Maître d'oeuvre : OSU-OREME (T. Bouvier/D. Bonnet), participants : C. Carré, C. Roques, P. Got, C. Bouvier, E. Hatey
  • Maîtrise d'ouvrage : OSU-OREME


INTERÊT SCIENTIFIQUE

Emprise géographique

Lagune de Thau

Paramètres suivis
  • Température
  • Salinité
  • Visibilité
  • Profondeur
  • Diversités et abondances des communautés phytoplanctoniques microzooplanctoniques et mésozooplanctoniques
  • Chlorophylle a
  • Bactéries totales
  • Picocyano, picoeucaryotes, nono-phyto
  • Prélèvement et conservation d'eau pour une banque d'ADN total disponible pour la communauté scientifique

ACCES DONNEES

  • Site web du réseau : http://data.oreme.org/plankton/plankton_thau_graphs
  • Banque d'échantillons : mésoplanctoniques, phytoplanctoniques disponibles (stockage dans du formol 2 et 4%), banque d'ADN microbien disponible depuis 2013 (stockage à -80°C de deux filtres par échantillonnage en amont de l'extraction des acides nucléiques et stockage de l'ADN extrait d'un filtre à -30°C), lames flagellés hétérotrophes conservées au congélateur

MARBEC MARine Biodiversity, Exploitation and Conservation, est une unité de recherche qui regroupe des personnels de 4 organismes : l’IRD, l’Ifremer, l’UM et le CNRS. Son objectif est l’étude de la biodiversité marine des écosystèmes lagunaires, côtiers et hauturiers à différents niveaux d’intégration, depuis les aspects moléculaires, individuels, populationnels et communautaires, et des usages de cette biodiversité par l’Homme. Nous rejoindre