2020

• Miriam Brandt, "Metabarcoding in the abyss : uncovering deep-sea biodiversity through environmental DNA", direction : S. Arnaud-Haond, D. Zeppilli.
• Valérie Derolez, "Approche dynamique et intégrée de l’évaluation d’un socio-écosystème côtier. Application à la lagune de Thau, son état écologique et ses bouquets de services écosystémiques sur la période 1970-2018", direction : C. Aliaume (UM), co-encadrants : N. Malet (Ifremer), R. Mongruel (Ifremer)
• Fabrice Houngnandan, "Impact des pressions anthropiques et de l’environnement sur les herbiers de posidonia oceanica en Méditerranée française", direction : J. Deter (UM)
• Virginie Marques, "Nécessité, potentiel et limitations de l’approche en unités taxonomiques moléculaires pour analyser la biodiversité de l ’ADN environnemental des poissons", direction : D. Mouillot (UM)
• Guilhem Marre, "Développement de la photogrammétrie et d’analyses d’images pour l’étude et le suivi d’habitats marins", direction : J. Deter (UM), S. Luque (INRAe)

2019

• Lucas BONNIN, "Apports de la télémétrie acoustique pour améliorer la conservation du requin gris de récif, Carcharhinus amblyrhynchos", direction : L. Dagorn (IRD) ; co-encadrants : D. Mouillot (UM) et L. Vigliola (IRD, Nouméa).
• Quentin QUEIROS "Mécanismes sous-jacents du contrôle bottom-updes populations de sardines dans le golfe du Lion : enseignements tirés des expériences et de la modélisation", direction : J-M Fromentin (Ifremer) ; co-encadrante : C. Saraux (CNRS, Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN, Strasbourg).
• Sabrine DRIRA "Vers une meilleure prise en compte des incertitudes dans le processus de la planification systémique de la conservation", direction : A. Ben Rejeb Jenhani (INAT Tunis) ; co-encadrante : Y.-Jai Shin (IRD).
• Thibaut L’HONORÉ "Plasticité phénotypique et variabilité intraspécifique de la tolérance à la dessalure chez le loup mediterranéen Dicentrarchus labrax",direction : C. Lorin-Nebel (UM) ; co-encadrante : É. Farcy (UM).
• Thomas TROMBETTA "Initiation des efflorescences phytoplanctoniques en zone côtière : le rôle de la température et des interactions biologiques",direction : B. Mostajir (CNRS) ; co-encadrante : F. Vidussi (CNRS).
• Antonia LEROY, discipline Droit public, "Les transformations du droit des pêches face à l’émergence d’un problème juridique : la pêche « illicite, non déclarée et non règlementée »", direction : F. Galletti (IRD).
• Jennifer BECKENSTEINER "Efficacy and unintended outcomes of spatial property rights for fisheries and aquaculture management in Chile and in Virginia, U.S.A.", direction : A. Scheld (VIMS) ; co-encadrant : D. M. Kaplan (IRD).
• Raquel MARQUES "Drivers and fates of jellyfish blooms. The case study of Aurelia coerulea in the Thau lagoon (North Western Mediterranean)",direction : A. Darnaude (CNRS) ; co-encadrante : D. Bonnet (UM).
• Killian CHARY, "Analyse environnementale intégrée pourle développement d’une aquaculture durable : scénarios de pisciculture marine dans le lagon de Mayotte", direction : A. Fiandrino (Ifremer).
• Mariam Maki SY "Évaluation des services écosystémiques fournis par les complexes lagunaires dans un processus de restauration écologique", direction : R. de Wit (CNRS), co-direction C. Figuières (Aix-Marseille Université).
• Sébastien VILLON "Estimation automatisée sur vidéos de la biodiversité et de l’abondance des poissons coralliens", co-direction : M. Chaumont (Université de Nîmes, LIRMM) et D. Mouillot (UM).
• Marine DAVID "Influence des apports d’eaux souterraines sur le fonctionnement hydrologique et biogéochimique des lagunes méditerranéennes - Cas de la lagune de l’Or", co-direction : A. Fiandrino (Ifremer) et T. Stieglitz (IRD, Marine Geophysical Laboratory).

• Matthew McLEAN, "Réponses fonctionnelles descommunautés de poissons aux gradients environnementaux en mer du Nord, Manche orientale,et baie de Somme", direction : P. Marchal (Ifremer) ; co-direction : A. Auber (Ifremer) et D. Mouillot(UM).
• Pavanee Angelee ANNASAWMY "Patterns among micronekton communities in relation to environmental conditions at two shallow seamounts in the South-western Indian Ocean". direction : F. Marsac (IRD et UCT) ; co-encadrant : C. Attwood (Universityof Cape Town, Afrique du Sud).
• Fabien MOULLEC, "Impacts du changement global sur la biodiversité en mer Méditerranée : une approche par modélisation End-to-End", direction :Y. Shin et F. Guilhaumon (IRD).
• Waliullah MASROOR, "Coping with salinity and temperature changes : a focus on the gill response in European sea bass Dicentrarchus labrax", Université de Montpellier
• Germain BOUSSARIE, "Apports de l’analyse de l’ADN environnemental et de la génomique du paysage pour la conservation des requins de récif", Université de Montpellier

2018

• Khady DIOP DIOUF, "Paramètres biologiques d’espèces de poissons d’intérêt socio-économique d’aires marines protégées (AMP) du Sénégal : pour une contribution à l’analyse de l’efficacité des AMP", Université Cheikh Anta Diop de Dakar
• Khalid-Hussain RIND, Physiologie de l’épinoche à 3 épines de Carmargue à différentes salinités, Université de Montpellier
• Frank LAGARDE, Ecologie de la reproduction de l’huître Crassostrea gigas en lagune méditerranéenne, UMR MARBEC Sète
• Achraf LAMLIH, Design of an integrated bioimpedance measurement system for chronic monitoring of biological tissue composition, LIRMM Montpellier
• Dimitri THEUERKAUFF, Effets des rejets d’eaux usées domestiques sur la physiologie et l’écologie des crabes de mangrove (Sesarmidae et Ocypodidae), Université de Montpellier
• Eva MAIRE, Les déterminants socio-écologiques de la biomasse en poissons sur les récifs coralliens : rôles de l’accessibilité, de la protection et des espèces-clés, Polytech Montpellier
• Saikou Oumar KIDE, Analyse de la diversité et de la structuration spatio-temporelle des assemblages démersaux dans la zone économique exclusive mauritanienne, MIO Marseille
• Helena LOPES GALASSO, Bioremédiation des rejets de poissons par un polychète détritivore en vue d’un système aquacole intégré multi-trophique, Université de Montpellier
• Inès LE FUR, Rôle des macrophytes dans la restauration des milieux lagunaires : successions écologiques
• Théo GABORIAU, Diversité globale des poissons coralliens : histoire évolutive et influence de l’environnement passé, Université de Montpellier

2017

• Marc BOUCHOUCHA, "Les zones portuaires peuvent-elles servir de nourriceries alternatives pour les poissons marins côtiers ? Cas des sars en Méditerranée nord-occidentale", Université de Perpignan
• Pierre CADEAU, "Cycles biogéochimiques du carbone de l’azote et du soufre dans un analogue des océans précambriens : le lac Dziani Dzaha", Institut de Physique du Globe de Paris
• Camille ASSALI, "Contribution des radars embarqués à l’étude des stratégies collectives de recherche alimentaire chez les oiseaux marins"
• Marlène CHIARELLO, "Biodiversité du microbiome cutané des organismes marins : variabilité, déterminants et importance dans l’écosystème"
• Quoc Khanh DOAN, "Genetic and genomic variation of resistance to viral nervous necrosis in wild populations of european seabass (Dicentrachus labrax)"
• Anne-Sophie TRIBOT, "Esthétique et biodiversité des écosystèmes sous-marins", Université de Montpellier
• Carlos Antonio BESERRA DA SILVA júnior, "Analyse de la vulnérabilité des poissons côtiers et estuariens du littoral du Pernambuco, basée sur des attributs bio-écologiques", Universidade Federal Rural de Pernambuco - Recife (Brésil)
• Alicia Dalongeville, "Variation génétique et persistance des populations en milieu marin : implications pour la conservation", CEFE Montpellier
• Antonin Blaison, "Écologie comportementale des requins bouledogue (Carcharhinus leucas) sur la côte de la Réunion", Université de La Réunion
• Aliou Ba, "Analyse microéconomique et modélisation bioéconomique de la pêcherie artisanale de sardinelles au Sénégal", Université Cheikh Anta Diop, Dakar, Sénégal
• Beenesh Anand Motah, "Environmental influences on tuna movement patterns in the Indian Ocean", Université de Cape Town (UCT), Afrique du Sud

2016

• Seyedeh Ainaz Shirangi, "Salinity tolerance of Persian sturgeon Acipenser Persicus juveniles"
• Claire Jacquet, "Intégration théorique de la biogéographie et du fonctionnement des écosystèmes"
• Pablo Brosset, "Condition corporelle et conséquences sur la plasticité des traits d’histoire de vie chez les petits pélagiques de Méditerranée"
• Célina Abi Khalil, "Effets apoptotiques du dinoflagellé Alexandrium catenella et de ses toxines sur les cellules immunitaires de l’huître creuse Crassostrea gigas. Implications dans la susceptibilité de l’huître aux vibrioses"
• Lauriane Escalle, "Interactions spatio-temporelles entre requins-baleines, cétacés et pêche thonière tropicale à la senne dans une perspective de conservation, dans les océans Atlantique et Indien"
• Alexandra Maufroy, "Dispositifs de Concentration de Poissons (DCP) des océans Atlantique et Indien : modalités d’utilisation, efficacité de pêche et potentialités de gestion"
• Mohamed Lamine Camara, "Biodiversité taxonomique et fonctionnelle des assemblages de poissons de Guinée et son évolution sous l’effet de la pêche"
• Fany Sardenne, "Des relations trophiques à l’état de santé : allocation d’énergie chez les thons tropicaux - Cas de l’ouest de l’océan Indien"
• Amandine Leruste, "Trajectoires d’évolution des communautés phytoplanctoniques au cours du processus de restauration écologique des milieux lagunaires méditerranéens", Université de Montpellier
• Giannina Passuni Saldana, "A bird-eye view on the spatio-temporal variability of the seasonal cycle in the Northern Humboldt Current System : the case of Guanay cormorant, Peruvian booby and Peruvian pelican"
• Jérôme Guiet, "Impacts des changements climatiques sur la structuration de la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes dans l’Océan Global. Une approche mécaniste de modélisation"
• Mariana Travassos Tolotti, "Ecology and conservation of the oceanic whitetip shark (Carcharhinuslongimanus"),Université Fédérale de Pernambuco (UFPE), Recife, Brésil
• Liliana Roa Pascuali, "Structure de meso-échelle et dynamique de l’environnement des thonidés tropicaux dans l’océan Indien et l’océan Pacifique Est ; approche comparative"

2015

• Eric Abadie, "Étude de Vulcanodinium rugosum (Dinoflagellé producteur de pinnatoxines) se développant dans la lagune méditerranéenne de l’Ingril"
• Elisabeth Van Beveren, "Population changes in small pelagic fish of the Gulf of Lions : a bottom-up control ?", Université de Montpellier
• Ely Beibou, "Géomatique Collaborative : mise en œuvre d’un Système d’information pour la gestion responsable des pêches en Mauritanie"
• Robert Bauer, "Development of a robust index of abundance for Atlantic bluefin tuna (Thunnus thynnus) through aerial surveys in the Northwestern Mediterranean Sea", Université de Montpellier
• Violette Turon, "Couplage de la fermentation sombre et de l’hétérotrophie microalgale : influences des métabolites fermentaires, de la lumière, de la température et des bactéries fermentaires sur la croissance algale", Université de Montpellier
• Ana Alegre, "Trophic ecology of jumbo squid and predatory fishes in the Northern Humboldt Current System", IMARPE, Pérou
• Stéphanie D’agata, "Biodiversité taxonomique, fonctionnelle et phylogénétique des communautés de poissons récifaux du Pacifique insulaire : influence relative des facteurs naturels et anthropique", Université de Montpellier