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  • Les dernières actualités l'UMR :
  • Internship, thesis, CDD, CDI offers

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    If none of these offers meet your expectations, you can send a speculative job application via the form online, enclosing a CV and a cover letter.

    Internship offers


    Master 2 Internship (2020-2021))
    Combination of distribution models of tropical tuna species and vulnerable by-catch species to define spatio-temporal strata for the prohibition of fishing under FADs in order to preserve the biodiversity of the deep-sea ecosystem of the tropical Atlantic Ocean.
    Main supervisor: Loreleï Guéry, IRD (lorelei.guery ird.fr)
    Supervisor: Daniel Gaertner, IRD (daniel.gaertner ird.fr) and Ilan Perez, IRD (ilan.perez ird.fr)
    Curriculum vitae and cover letter to be sent only to supervisors before 23 October 2020

    Offres de CDD

  • Environmental DNA: scientific animation film

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    Film made by students of the UM’s B2E Master’s programme, as part of the Communication and Environmental Education course directed by Frédérique Carcaillet, Teacher-Researcher.

  • Last publications

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    Bibliographic database: publications from 2015 to 2020


    • Baidai, Y., Dagorn, L., Amande, M. J., Gaertner, D., Capello, M. (2020). Machine learning for characterizing tropical tuna aggregations under Drifting Fish Aggregating Devices (DFADs) from commercial echosounder buoys data. Fisheries Research 229, 105613. doi:10.1016/j.fishres.2020.105613
    • Ben Rais Lasram, F., Hattab, T., Nogues, Q., Beaugrand, G., Dauvin, J. C., Halouani, G., Le Loc’h, F., Niquil, N., Leroy, B. (2020). An open-source framework to model present and future marine species distributions at local scale. Ecological Informatics 59, 101130. doi:10.1016/j.ecoinf.2020.101130
    • Blasco, F. R., Esbaugh, A. J., Killen, S. S., Rantin, F. T., Taylor, E. W., McKenzie, D. J. (2020). Using aerobic exercise to evaluate sub-lethal tolerance of acute warming in fishes. J. Exp. Biol., 223, jeb218602. doi:10.1242/jeb.218602
    • Bouyoucos, I. A., Romaine, M., Azoulai, L., Eustache, K., Mourier, J., Rummer, J. L., Planes, S. (2020). Home range of newborn blacktip reef sharks (Carcharhinus melanopterus), as estimated using mark-recapture and acoustic telemetry. Coral Reefs. doi:10.1007/s00338-020-01965-z
    • Cardiec, F., Bertrand, S., Witt, M. J., Metcalfe, K., Godley, B. J., McClellan, C., Vilela, R., Parnell, R. J., Le Loc’h, F. (2020). “Too Big To Ignore”: A feasibility analysis of detecting fishing events in Gabonese small-scale fisheries. PLoS ONE 15(6): e0234091. doi:10.1371/journal.pone.0234091
    • Cecchi, P., Forkuor, G., Cofie, O., Lalanne, F., Poussin, J.-C., Jamin, J.-Y. (2020). Small reservoirs, landscape changes and water quality in Sub-Saharan West Africa. Water 12, 1967. doi:10.3390/w12071967
    • Clavareau, L., Sabarros, P. S., Escalle, L., Bach, P., Abascal, F. J., Lopez, J., Murua, H., Pascual Alayon, P. J., Ramos, M. L., Ruiz, J., Mérigot, B. (2020). Elasmobranch bycatch distributions and mortality: Insights from the European tropical tuna purse-seine fishery. Global Ecology and Conservation 24, e01211. doi:10.1016/j.gecco.2020.e01211
    • Cozzoli, F., Gomes da Conceição, T., Van Dalen, J., Fang, X., Gjoni, V., Herman, P. M. J., Hu, Z., Soissons, L. M., Walles, B., Ysebaert, T., Bouma, T. J. (2020). Biological and physical drivers of bio-mediated sediment resuspension: A flume study on Cerastoderma edule. Estuar. Coast. Shelf Sci., 241, 106824. doi:10.1016/j.ecss.2020.106824
    • Forget, F., Dagorn, L., Mérigot, B., Gaertner, J. C., Robinson, J., Cowley, P. D., Adam, M. S., Rilwan, Y., Koonjul, M., Mangar, V., Taquet, M., Ménard, F. (2020). Beta diversity of pelagic assemblages at fish aggregating devices in the open ocean. African Journal of Marine Science 42, 247–254. doi:10.2989/1814232X.2020.1774804
    • Goikoetxea, A., Sadoul, B., Blondeau-Bidet, E., Aerts, J., Blanc, M.-O., Parrinello, H., Barrachina, C., Pratlong, M., Geffroy, B., 2021. Genetic pathways underpinning hormonal stress responses in fish exposed to short- and long-term warm ocean temperatures. Ecological Indicators 120, 106937. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106937
    • Griot, R., Allal, F., Phocas, F., Brard-Fudulea, S., Morvezen, R., Bestin, A., Haffray, P., François, Y., Morin, T., Poncet, C., Vergnet, A., Cariou, S., Brunier, J., Bruant, J.-S., Peyrou, B., Gagnaire, P.-A., Vandeputte, M., 2021. Genome-wide association studies for resistance to viral nervous necrosis in three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a novel 57k SNP array DlabChip. Aquaculture 530, 735930. https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2020.735930
    • Jaonalison, H., Durand, J.-D., Mahafina, J., Demarcq, H., Teichert, N., Ponton, D. (2020). Predicting species richness and abundance of tropical post-larval fish using machine learning. Marine Ecology Progress Series 645, 125–139. https://www.int-res.com/abstracts/meps/v645/p125-139/
    • Le Marchand, M., Hattab, T., Niquil, N., Albouy, C., Le Loc’h, F., Ben Rais Lasram, F. (2020). Climate change in the Bay of Biscay: Changes in spatial biodiversity patterns could be driven by the arrivals of southern species. Marine Ecology Progress Series 647, 17–31. doi:10.3354/meps13401
    • Leblad, B. R., Amnhir, R., Reqia, S., Sitel, F., Daoudi, M., Marhraoui, M., Abdellah, M. K. O., Veron, B., Er-Raioui, H., Laabir, M. (2020). Seasonal variations of phytoplankton assemblages in relation to environmental factors in Mediterranean coastal waters of Morocco, a focus on HABs species. Harmful Algae 96, 101819. doi:10.1016/j.hal.2020.101819
    • McKenzie, D. J., Palstra, A. P., Planas, J., MacKenzie, S., Begout, M.-L., Thorarensen, H., Vandeputte, M., Mes, D., Rey, S., De Boeck, G., Domenici, P., Skov, P. V. (2020). Aerobic swimming in intensive finfish aquaculture: applications for production, mitigation and selection. Rev. Aquac. doi:10.1111/raq.12467
    • Mendoza‐Portillo, V., Galván‐Tirado, C., Portnoy, D. S., Valenzuela‐Quiñonez, F., Domínguez‐Domínguez, O., Durand, J.-D., Pérez‐Urbiola, J. C., León, F. J. G.-D. (2020). Genetic diversity and structure of circumtropical almaco jack, Seriola rivoliana: tool for conservation and management. Journal of Fish Biology. doi:10.1111/jfb.14450
    • Olokotum, M., Mitroi, V., Troussellier, M., Semyalo, R., Bernard, C., Montuelle, B., Okello, W., Quiblier, C., Humbert, J.-F. (2020). A review of the socioecological causes and consequences of cyanobacterial blooms in Lake Victoria. Harmful Algae 96, 101829. doi:10.1016/j.hal.2020.101829
    • Rodde, C., Chatain, B., Vandeputte, M., Trinh, T. Q., Benzie, J. A. H., de Verdal, H. (2020). Can individual feed conversion ratio at commercial size be predicted from juvenile performance in individually reared Nile tilapia Oreochromis niloticus? Aquacult. Rep., 17, UNSP 100349. doi:10.1016/j.aqrep.2020.100349
    • Rummer, J. L., Bouyoucos, I. A., Mourier, J., Nakamura, N., Planes, S. (2020). Responses of a coral reef shark acutely exposed to ocean acidification conditions. Coral Reefs. doi:10.1007/s00338-020-01972-0
    • Soares, A., Lira, A. S., Gonzalez, J. G., Eduardo Nolé, L., Lucena-Frédou, F., Le Loc’h, F., Ferreira, B. P., Frédou, T. (2020). Feeding habits and population aspects of the spotted goatfish, Pseudupeneus maculatus (Perciformes: Mullidae), on the continental shelf of northeast Brazil. Sci. Mar., 84, 119–131. doi:10.3989/scimar.04958.24A
    • Viblanc, V. A., Schull, Q., Stier, A., Durand, L., Lefol, E., Robin, J.-P., Zahn, S., Bize, P., Criscuolo, F. (2020). Foster rather than biological parental telomere length predicts offspring survival and telomere length in king penguins. Mol. Ecol. doi:10.1111/mec.15485
  • Accumulation curves of environmental DNA sequences predict coastal fish diversity in the Coral Triangle

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    Des chercheurs de l’IRD, de l’Université de Montpellier, de l’Institut indonésien des sciences (LIPI) et leurs partenaires ont étudié la biodiversité des poissons récifaux du Triangle de Corail grâce à l’ADN environnemental. Cette méthode, utilisée pour la première fois dans la région, révèle la diversité des espèces présentes, malgré une base de référence de code-barres ADN très fragmentaire. Ces résultats, publiés le 8 juillet dans Proceedings of the Royal Society B., ouvrent la voie à l’utilisation de cette technique dans les écosystèmes les plus riches en biodiversité et les moins étudiés de la planète. Communiqué de presse

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    © IRD - Gilles DiRaimondo / Lengguru

    Référence : Juhel Jean-Baptiste, Utama Rizkie S., Marques Virginie, Vimono Indra B. , Sugeha Hagi Y., Kadarusman, Pouyaud Laurent, Dejean Tony, Mouillot David, Hocdé Régis. Accumulation curves of environmental DNA sequences predict coastal fish diversity in the Coral Triangle. Proceedings of the Royal Society B., 8 juillet 2020. https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2020.0248.

  • "Qu’est-ce-que j’ai à voir avec les oiseaux marins ?"

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    Conférence de Sophie Bertrand le 16/06/2020 à 14h00

    La mer n’est-elle qu’un nouvel espace de croissance bleue ? Ou est-il possible d’y repenser nos projets sur la base de la notion de solidarité écologique ? En un mot, quel avenir souhaitons-nous pour nos océans ? Le débat est ouvert. Lors de cette conférence, Sophie Bertrand, écologue marin, nous présentera comment la technologie permet aujourd’hui de suivre les déplacements et les comportements des grands organismes marins, notamment les oiseaux, de cartographier les zones d’importance afin de nourrir les politiques publiques de gestion des usages des espaces marins.

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    Rejoignez la conférence sur - https://meet.jit.si/RVduMardiDROMeetJitsi

  • El Niño Southern Oscillation (ENSO) effects on fisheries and aquaculture

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    Ce rapport publié par la FAO, en partenariat avec l’IRD, fait le point sur les connaissances acquises jusqu’à présent sur le phénomène El Niño et sur ses répercussions sur différents secteurs, tels que la sécurité alimentaire, la sécurité en mer, la biologie des ressources marines, les opérations de pêche, l’aquaculture ou encore les mesures de gestion et d’adaptation.
    Référence : Bertrand, A., Lengaigne, M., Takahashi, K., Avadí, A., Poulain, F. & Harrod, C. 2020. El Niño Southern Oscillation effects on fisheries and aquaculture. FAO Fisheries and Aquaculture Technical Paper No. 660. Rome, FAO. pdf to download (8.61 Mo)

    Press releases :

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MARBEC MARine Biodiversity, Exploitation and Conservation, is a research unit which includes the staff of 4 organizations: IRD, IFREMER, UM and CNRS. Its objective is the study of marine biodiversity in lagoon coastal and offshore ecosystems, at different integration levels, molecular, individual, population and community aspects and the way humans use this biodiversity.